Урожайность.

Как сравнить урожайность двух деревьев, разных по размерам кроны и занимаемой площади?

В данном случае сравнивается продуктивность, а не урожайность. Урожайность это масса урожая с единицы площади, например, с 1 га, с 1 сотки, с 1 кв. м. В вашем случае уместнее сравнивать удельную продуктивность с одного погонного метра ветви. Для этого продуктивность деревьев следует разделить на длину ветвей. Однако полностью полагаться на результат одного года не правильно. Для достоверного результата следует определять этот показатель в течение как минимум 3 лет и вычислить среднемноголетнее значение. Сравнивать среднемноголетние показатели положено для всех культур, а для яблонь и других плодовых деревьев это особенно актуально из-за периодичности плодоношения.